Покончить с Капоне взялся новый глава ФБР Эдгар Гувер. Поняв, что за убийства и рэкет посадить главаря мафии не получится, он зашёл с другой стороны.
Сначала в 1929 году Аля Капоне осудили на 10 месяцев тюрьмы за незаконное ношение оружия. Но этого срока Капоне даже не заметил — он жил в тюрьме с комфортом, принимал посетителей и продолжал управлять группировкой.
Однако в 1931 году Аля Капоне осудили на 11 лет за неуплату налогов.
Первые несколько лет Великий Аль все еще вел темные дела прямиком из тюрьмы. А уже после перевода в Алькатрас — жизнь пошла под откос.
Врачи диагностировали у него сифилис и гонорею, а также кокаиновую зависимость, которые сильно ударили по здоровью.
В 1939 году Аль Капоне, пораженного частичным параличом, освободили по состоянию здоровья. Своё влияние в криминальном мире он потерял, да и не мог этот больной и постаревший человек, как раньше, железной рукой управлять группировкой в 1000 бандитов.
Могила короля криминального мира находится в Чикаго, под ничем не примечательной каменной плитой
с его именем.
Аль Капоне умер 25 января 1947 года от остановки сердца в возрасте 48 лет в окружение своей семьи.